二、组蛋白修饰的"Writer-Reader-Eraser"模型

1. Writer（写入器）
组蛋白乙酰转移酶（HAT）：
- 将乙酰基从乙酰辅酶A转移到组蛋白赖氨酸残基上
- 家族分类：GNAT家族（GCN5、PCAF）、MYST家族（MOZ、YBF2、SAS2、TIP60）、p300/CBP家族
- 功能：中和赖氨酸正电荷，减弱与DNA的相互作用，促进染色质开放
组蛋白甲基转移酶（HMT）：
- 以S-腺苷甲硫氨酸（SAM）为甲基供体
- 赖氨酸甲基转移酶：SET结构域家族（如MLL、EZH2、SETD2、SUV39H1）
- 精氨酸甲基转移酶：PRMT家族（PRMT1、PRMT4/CARM1、PRMT5）
- 功能：不改变电荷，但增加空间位阻，影响蛋白质相互作用
2. Eraser（擦除器）
组蛋白去乙酰化酶（HDAC）：
- 去除赖氨酸残基上的乙酰基
- 家族分类：Class I（HDAC1/2/3/8）、Class II（HDAC4/5/6/7/9/10）、Class III/Sirtuins（SIRT1-7）、Class IV（HDAC11）
- 功能：恢复赖氨酸正电荷，增强与DNA的相互作用，促进染色质压缩
组蛋白去甲基化酶（KDM）：
- KDM1/LSD1家族：黄素依赖氧化酶，主要去除H3K4me1/2和H3K9me2
- JmjC家族：α-酮戊二酸依赖的双加氧酶，可去除多种甲基化修饰（H3K4、H3K9、H3K27、H3K36等）
3. Reader（读取器）
溴结构域（Bromodomain）：
- 识别乙酰化赖氨酸
- 家族成员：BRD2/3/4、BRDT、PBRM1等
- 功能：招募转录机器和染色质重塑复合物
染色质结构域（Chromodomain）：
- 识别甲基化赖氨酸
- HP1（识别H3K9me3）、PRC1（识别H3K27me3）
- 功能：介导异染色质形成和基因沉默
Tudor结构域、PHD结构域、WD40重复等：
- 识别不同甲基化状态
- 功能：参与DNA修复、转录调控和细胞信号传导