🔧 tool

一、一代测序:Sanger双脱氧链终止法

Sanger测序的核心是利用ddNTP终止DNA链延伸: 1. **反应体系**:模板DNA、引物、DNA聚合酶、四种dNTP(其中一种带有放射性或荧光标记)和少量ddNTP 2. **链延伸与终止**:DNA聚合酶沿模板合成新链,遇到dNTP时正常延伸,遇到ddNTP时因缺少3'-OH而终止 3. **四个独立反应**:分别加入ddATP、ddCTP、ddGTP、ddTTP,产生四组不同长度的片...

📖 定义

Sanger测序的核心是利用ddNTP终止DNA链延伸:
1. 反应体系:模板DNA、引物、DNA聚合酶、四种dNTP(其中一种带有放射性或荧光标记)和少量ddNTP
2. 链延伸与终止:DNA聚合酶沿模板合成新链,遇到dNTP时正常延伸,遇到ddNTP时因缺少3'-OH而终止
3. 四个独立反应:分别加入ddATP、ddCTP、ddGTP、ddTTP,产生四组不同长度的片段
4. 电泳分离:通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)或毛细管电泳按大小分离片段
5. 读取序列:从短到长读取末端碱基,获得互补链序列
自动化Sanger测序使用四种不同荧光标记的ddNTP,四个反应在同一管中进行,通过激光检测荧光颜色确定碱基类型。
局限性:通量低(每次反应只能读取一条序列),成本高,不适合大规模基因组项目。