🔧
tool
五、非编码RNA预测
非编码RNA（ncRNA）是不编码蛋白质的RNA分子，包括： - **miRNA**（微小RNA）：~22 nt，调控基因表达 - **lncRNA**（长链非编码RNA）：>200 nt，多种调控功能 - **circRNA**（环状RNA）：共价闭合环，miRNA海绵等 - **tRNA、rRNA、snRNA、snoRNA**等 预测方法： - **miRNA**：基于发夹结构、种子区域保守性...
📖 定义
非编码RNA（ncRNA）是不编码蛋白质的RNA分子，包括：
- miRNA（微小RNA）：~22 nt，调控基因表达
- lncRNA（长链非编码RNA）：>200 nt，多种调控功能
- circRNA（环状RNA）：共价闭合环，miRNA海绵等
- tRNA、rRNA、snRNA、snoRNA等
预测方法：
- miRNA：基于发夹结构、种子区域保守性、热力学稳定性（RNAfold、miRDeep2）
- lncRNA：基于开放阅读框长度、编码潜能（CPAT、CPC2）、序列保守性
- circRNA：基于反向剪接位点（backsplice junction）的reads支持（CIRI、find_circ）