一、RNA修饰的主要类型

1. 碱基修饰
m⁶A（N⁶-甲基腺苷）：
- 分布：mRNA（约0.1-0.4%的腺苷被修饰）、lncRNA、pri-miRNA
- 共识序列：DRACH（D = A/G/U, R = A/G, H = A/C/U）
- Writer复合物：METTL3（催化亚基）、METTL14（底物识别）、WTAP（调控亚基）、VIRMA/KIAA1429（底物定位）
- Eraser：FTO（肥胖相关蛋白）、ALKBH5（AlkB同源蛋白5）
- Reader：YTHDF1（促进翻译）、YTHDF2（促进降解）、YTHDF3（促进翻译）、YTHDC1（调控剪接）、YTHDC2（调控翻译）、IGF2BP1/2/3（促进稳定性）
- 功能：调控mRNA稳定性、翻译效率、剪接模式、细胞定位和相分离
m⁵C（5-甲基胞苷）：
- 分布：tRNA、rRNA、mRNA
- Writer：NSUN2（tRNA和mRNA）、NSUN6（tRNA）
- Eraser：TET家族（可氧化m⁵C为hm⁵C）
- Reader：ALYREF（核输出因子）
- 功能：影响翻译效率、密码子使用、RNA结构稳定性
m¹A（N¹-甲基腺苷）：
- 分布：tRNA、rRNA、mRNA
- Writer：TRMT6/61A（tRNA）、TRMT6/61B（mRNA）
- 功能：影响翻译起始和延伸
m⁷G（N⁷-甲基鸟苷）：
- 分布：mRNA 5'帽子结构、rRNA、tRNA
- Writer：RNMT（mRNA帽子）、METTL1（tRNA）
- 功能：mRNA帽子识别、翻译起始
Ψ（假尿苷）：
- 分布：tRNA、rRNA、snRNA、少量mRNA
- Writer：PUS酶家族（蛋白质）或snoRNP（snoRNA指导）
- 功能：增强RNA结构稳定性、影响密码子解码、调控剪接
A→I（腺苷到肌苷编辑）：
- 酶：ADAR家族（ADAR1、ADAR2）
- 功能：改变密码子（如谷氨酰胺密码子CAG变为精氨酸密码子CGG），影响蛋白质序列
2. 核糖修饰
2'-O-Me（2'-O-核糖甲基化）：
- 分布：rRNA、tRNA、snRNA、部分mRNA
- Writer：snoRNP复合物（C/D box snoRNA指导）
- 功能：增强RNA对碱水解的抗性，影响翻译效率
3. 混合型修饰
m⁶Am（N⁶,2'-O-二甲基腺苷）：
- 分布：mRNA 5'帽子结构
- 功能：保护mRNA 5'端，调控翻译效率