四、circRNA的特性与功能

circRNA的生物合成：
1. 剪接体依赖的环化：下游外显子的5'端供体位点与上游的3'端受体位点结合
2. 内含子配对驱动：反向互补基序（如Alu元件）促进环化
3. 套索驱动：外显子跳过剪接产生的套索状副产物进一步环化
circRNA的独特性质：
- 高稳定性：无5'/3'端，对核酸外切酶免疫，半衰期可达数天（mRNA通常数小时）
- 组织特异性：具有较强的时间和组织表达特性
- 进化保守性：不同物种间具有一定保守性
circRNA的功能：
1. miRNA海绵：CDR1as含有63个miR-7结合位点
2. 调控亲本基因：与RNA结合蛋白互作，调节亲本基因表达
3. 翻译蛋白质：部分circRNA具有IRES和ORF，可翻译功能性蛋白
circRNA的计算鉴定：
- 主流方法：筛选不能线性比对的reads，检测反向剪接位点
- 工具：find_circ, CIRCexplorer, CIRI