二、KEGG通路注释

KEGG数据库的核心是通路图（Pathway Map），包括：
- 代谢通路（Metabolism）：碳水化合物代谢、能量代谢、脂质代谢、核苷酸代谢、氨基酸代谢等
- 遗传信息处理（Genetic Information Processing）：转录、翻译、折叠/分选/降解、复制与修复
- 环境信息处理（Environmental Information Processing）：膜转运、信号转导、配体-受体相互作用
- 细胞过程（Cellular Processes）：细胞生长与死亡、细胞群落、运输与分解代谢
- 生物体系统（Organismal Systems）：免疫系统、神经系统、内分泌系统等
- 人类疾病（Human Diseases）：癌症、神经退行性疾病、心血管疾病等
KEGG注释方法：
- 序列比对法：用BLAST/KAAS（KEGG Automatic Annotation Server）将基因与KEGG GENES数据库比对
- KO（KEGG Orthology）注释：将基因映射到KO编号（功能单位），再根据KO编号映射到通路
- 工具：KAAS、KOFAM、eggNOG-mapper