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concept
一、基因组浏览器的核心功能
**(1)线性序列展示** - 以染色体为坐标轴,从左到右展示DNA序列 - 支持不同尺度的缩放(从单碱基到全染色体) - 显示正反链的序列和注释 **(2)多轨道(Track)整合** - 每个track代表一类数据(基因注释、测序reads、变异、保守性等) - 用户可自定义加载、排列和配置track - 支持track的叠加和比较 **(3)交互式查询** - 通过基因名、染色体坐标、rsI...
📖 定义
(1)线性序列展示
- 以染色体为坐标轴,从左到右展示DNA序列
- 支持不同尺度的缩放(从单碱基到全染色体)
- 显示正反链的序列和注释
(2)多轨道(Track)整合
- 每个track代表一类数据(基因注释、测序reads、变异、保守性等)
- 用户可自定义加载、排列和配置track
- 支持track的叠加和比较
(3)交互式查询
- 通过基因名、染色体坐标、rsID等定位基因组区域
- 支持序列搜索(如查找特定基序)
- 支持不同物种间的基因组比对(synteny view)
(4)数据导出
- 导出特定区域的序列(FASTA)
- 导出track数据(BED、GTF等)
- 生成高质量图片用于发表