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concept
五、可视化
**（1）火山图（Volcano Plot）** - X轴：log₂ Fold Change - Y轴：-log₁₀(p-value) - 每个点代表一个基因 - 同时展示效应大小（FC）和统计显著性（p-value） - 右上和左上的点分别代表显著上调和下调的基因 **（2）MA图（MA Plot）** - X轴：log₂(mean expression) —— 平均表达量 - Y轴：log₂...
📖 定义
（1）火山图（Volcano Plot）
- X轴：log₂ Fold Change
- Y轴：-log₁₀(p-value)
- 每个点代表一个基因
- 同时展示效应大小（FC）和统计显著性（p-value）
- 右上和左上的点分别代表显著上调和下调的基因
（2）MA图（MA Plot）
- X轴：log₂(mean expression) —— 平均表达量
- Y轴：log₂ Fold Change
- 用于检查数据标准化效果：好的标准化应该使低表达和高表达基因的FC分布对称
（3）热图（Heatmap）
- 展示差异表达基因在不同样本中的表达模式
- 通常结合层次聚类，识别共表达基因模块
（4）PCA图
- 展示样本间的整体相似性
- 用于检测异常样本和批次效应