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concept
五、差异丰度分析
识别在不同组间丰度显著差异的微生物或功能基因： - **LEfSe（Linear Discriminant Analysis Effect Size）**：结合统计检验和LDA评分，筛选组间差异标志物 - **ANCOM（Analysis of Composition of Microbiomes）**：考虑微生物组数据的组成性特点 - **DESeq2/edgeR**：基于负二项分布的差异分析（...
📖 定义
识别在不同组间丰度显著差异的微生物或功能基因：
- LEfSe（Linear Discriminant Analysis Effect Size）：结合统计检验和LDA评分，筛选组间差异标志物
- ANCOM（Analysis of Composition of Microbiomes）：考虑微生物组数据的组成性特点
- DESeq2/edgeR：基于负二项分布的差异分析（适用于OTU/基因计数数据）
- ALDEx2：考虑组成性和稀疏性的差异分析