生物化学与分子生物学

生物信息学在生物化学与分子生物学领域中发挥着关键作用。以"DNA—RNA—蛋白质"为主要对象，分析编码区和非编码区中信息结构和编码特征，挖掘其中的规律，探究理解信息调节与表达规律等。
核心应用包括：
- 基因识别与注释：通过计算算法从基因组序列中识别基因的位置、结构和功能
- 蛋白质功能预测：基于序列相似性推断未知蛋白质的功能
- 序列 motif 发现：识别DNA或蛋白质序列中的保守模式（如转录因子结合位点）
- 分子进化分析：重建基因和蛋白质家族的进化历史
由于生物功能的主要体现者是蛋白质和其他各类生物分子，研究它们的生成过程、修饰加工、转运定位、结构变化、相互作用等活动，将推动对生物分子的功能、表达和调控的理解。生物信息学通过计算模拟，可以预测蛋白质的三维结构、分子间的相互作用界面，为实验设计提供指导。