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concept
四、批次效应整合
当多个样本或批次的数据需要合并分析时，批次效应是一个严重问题。 **整合方法**： - **CCA（Canonical Correlation Analysis）**：Seurat v3的整合方法，找到跨批次共享的相关基因模块 - **Harmony**：快速、灵活的整合方法，适用于大规模数据 - **scVI**：基于变分自编码器的深度学习方法 - **ComBat/sva**：统计学校正方法
📖 定义
当多个样本或批次的数据需要合并分析时，批次效应是一个严重问题。
整合方法：
- CCA（Canonical Correlation Analysis）：Seurat v3的整合方法，找到跨批次共享的相关基因模块
- Harmony：快速、灵活的整合方法，适用于大规模数据
- scVI：基于变分自编码器的深度学习方法
- ComBat/sva：统计学校正方法