💡
concept
四、混合组装策略
利用二代和三代数据的互补性： **（1）二代纠错三代** - 用高准确性的二代reads对三代reads进行纠错 - 代表工具：PBcR、LoRDEC、Jabba - 纠错后的三代reads准确性可提升至>99% **（2）三代搭建骨架，二代填充** - 用三代长读长构建初步的contig骨架 - 用二代reads对三代contig进行 polish（填补gap、纠正碱基错误） - 代表工具：Pi...
📖 定义
利用二代和三代数据的互补性：
（1）二代纠错三代
- 用高准确性的二代reads对三代reads进行纠错
- 代表工具：PBcR、LoRDEC、Jabba
- 纠错后的三代reads准确性可提升至>99%
（2）三代搭建骨架，二代填充
- 用三代长读长构建初步的contig骨架
- 用二代reads对三代contig进行 polish（填补gap、纠正碱基错误）
- 代表工具：Pilon、Racon
（3）graph-based混合组装
- 将二代和三代数据同时输入组装算法
- 在组装图中同时利用短读长的准确性和长读长的连续性
- 代表工具：HybridSPAdes、MaSuRCA