💡
concept
四、混合测序策略设计
一个典型的T2T基因组项目测序策略: | 数据类型 | 测序深度 | 用途 | |----------|---------|------| | PacBio HiFi | 30-50× | 主要组装,产生高质量contig | | Nanopore Ultra-long | 10-20× | 跨越超长重复区域,解决复杂区域 | | Illumina PE150 | 50-100× | 纠错、质量验...
📖 定义
一个典型的T2T基因组项目测序策略:
| 数据类型 | 测序深度 | 用途 |
|----------|---------|------|
| PacBio HiFi | 30-50× | 主要组装,产生高质量contig |
| Nanopore Ultra-long | 10-20× | 跨越超长重复区域,解决复杂区域 |
| Illumina PE150 | 50-100× | 纠错、质量验证 |
| Hi-C | 60-100× | 染色体级别scaffold |
| 光学图谱 | 5-10× | 验证组装结构 |