四、翻译后修饰蛋白质组学

磷酸化蛋白质组学：
- 磷酸化是真核细胞中最常见的PTM，超过3/4的蛋白质经历磷酸化
- 主要发生在Ser（~90%）、Thr（~10%）和Tyr（~1%）
- 富集策略：IMAC（固定化金属离子亲和色谱）、TiO₂、抗体富集（pTyr）
- 鉴定挑战：磷酸化肽段在质谱中信号较弱，且可能产生中性丢失（H₃PO₄）
- 软件：MaxQuant、Proteome Discoverer、pFind（支持磷酸化位点定位）
糖基化蛋白质组学：
- N-糖基化：Asn-X-Ser/Thr序列模体（X≠Pro），发生在内质网/高尔基体
- O-糖基化：主要发生在Ser/Thr，无特定序列模体
- 富集策略：凝集素亲和色谱、亲水相互作用色谱（HILIC）
- 鉴定挑战：糖链异质性导致同一肽段产生多种糖型
- 软件：Byonic、pGlyco、NGlycan
泛素化蛋白质组学：
- 泛素化通过蛋白酶体途径调控蛋白质降解
- 富集策略：K-GG抗体（识别泛素化留下的Lys-Gly-Gly足迹）
- 应用：泛素-蛋白酶体系统研究、药物靶点发现（如蛋白酶体抑制剂）