💡
concept
三、泛基因组学
泛基因组分为两部分： - **核心基因组（Core Genome）**：物种所有个体共有的基因，通常与基本生命功能相关 - **可变基因组/附属基因组（Accessory/Dispensable Genome）**：仅在部分个体中存在的基因，通常与环境适应、致病性、代谢多样性等相关 泛基因组构建方法： - **迭代式**：将新个体的基因组与已有泛基因组比较，添加新序列 - **图基因组（Graph...
📖 定义
泛基因组分为两部分：
- 核心基因组（Core Genome）：物种所有个体共有的基因，通常与基本生命功能相关
- 可变基因组/附属基因组（Accessory/Dispensable Genome）：仅在部分个体中存在的基因，通常与环境适应、致病性、代谢多样性等相关
泛基因组构建方法：
- 迭代式：将新个体的基因组与已有泛基因组比较，添加新序列
- 图基因组（Graph Genome）：将所有序列变异表示为图结构，而非线性序列
泛基因组的应用：
- 捕获参考基因组中缺失的遗传多样性
- 改进变异检测（减少比对偏差）
- 识别与重要性状相关的基因（如作物抗病基因）