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concept
四、多组学数据整合可视化
现代基因组研究往往涉及多组学数据的整合： - **基因组层**：基因结构、变异位点 - **转录组层**：RNA-Seq信号、剪接异构体 - **表观组层**：ChIP-Seq峰（组蛋白修饰、转录因子结合）、DNA甲基化、ATAC-Seq开放染色质 - **三维结构层**：Hi-C相互作用矩阵、TAD边界 - **进化层**：跨物种保守性分数（phyloP, phastCons） 整合可视化可以帮...
📖 定义
现代基因组研究往往涉及多组学数据的整合：
- 基因组层：基因结构、变异位点
- 转录组层：RNA-Seq信号、剪接异构体
- 表观组层：ChIP-Seq峰（组蛋白修饰、转录因子结合）、DNA甲基化、ATAC-Seq开放染色质
- 三维结构层：Hi-C相互作用矩阵、TAD边界
- 进化层：跨物种保守性分数（phyloP, phastCons）
整合可视化可以帮助发现跨层面的关联，例如：
- 某个增强子区域（H3K27ac峰+ATAC-Seq开放区）与远处基因的启动子有Hi-C相互作用
- 一个SNP位于保守非编码区，且与附近基因的表达量显著相关