六、多组学整合

代谢组学与其他组学的整合：
基因组+代谢组：
- 全基因组关联分析（mGWAS）：代谢物作为表型，发现代谢QTL（mQTL）
- 识别代谢酶的遗传变异对代谢物水平的影响
转录组+代谢组：
- 整合基因表达和代谢物水平，构建代谢调控网络
- 识别限速酶和调控节点
蛋白质组+代谢组：
- 同时检测酶蛋白水平和代谢物水平
- 验证代谢通路的活性状态
微生物组+代谢组：
- 肠道菌群16S/宏基因组 + 粪便/血清代谢组
- 揭示菌群-宿主代谢互作（如SCFA产生、胆汁酸代谢）
整合方法：
- 相关性网络：计算代谢物与基因/蛋白质之间的Pearson/Spearman相关性
- 联合通路分析：如IMPaLA、iPEA
- 多组学因子分析（MOFA）：识别跨组学的共享变异源
- 机器学习整合：使用多组学特征构建预测模型