四、Indel注释和功能影响

Indel的功能影响通常比SNP更严重：
| Indel类型 | 功能影响 | 示例 |
|----------|---------|------|
| 编码区非3倍数Indel | 移码突变，通常导致功能丧失 | BRCA1移码突变导致乳腺癌风险 |
| 编码区3倍数Indel | 氨基酸插入/缺失，可能影响功能 | CFTR ΔF508导致囊性纤维化 |
| 剪接位点Indel | 影响pre-mRNA剪接 | 深度内含子Indel激活隐蔽剪接位点 |
| 调控区Indel | 影响转录因子结合 | 胰岛素基因启动子Indel影响表达 |
| UTR区Indel | 可能影响mRNA稳定性或翻译 | 5'UTR的uORF相关Indel |
经典病例：
- 囊性纤维化：CFTR基因最常见的突变是ΔF508（一个3bp缺失），导致苯丙氨酸缺失，约占所有囊性纤维化病例的70%
- 亨廷顿舞蹈症：HTT基因中CAG重复序列的扩增（可视为一种特殊Indel），当CAG重复数>36时导致疾病