分子标记辅助育种的原理

1. QTL定位
数量性状位点（Quantitative Trait Locus, QTL）定位是MAB的基础。通过构建分离群体（如F2、RIL、DH），获得标记基因型和表型数据，利用统计分析检测与性状显著关联的染色体区域。
常用方法：
- 单标记分析（SMA）：检验单个标记与性状的关联
- 区间作图（IM）：利用两侧标记信息，检测标记区间内的QTL
- 复合区间作图（CIM）：在区间作图基础上，加入背景标记控制多QTL效应
- 全基因组关联分析（GWAS）：利用自然群体中的连锁不平衡（LD），不需要构建专门的家系
2. MAS（Marker-Assisted Selection）策略
- 前景选择：利用与目标QTL紧密连锁的标记，选择携带有利等位基因的个体。
- 背景选择：利用全基因组标记，监测轮回亲本的基因组恢复程度，加速回交育种进程。
- 基因聚合（Gene Pyramiding）：将多个有利基因/QTL聚合到同一个品种中。
3. 标记类型
从RFLP、AFLP、SSR发展到目前的SNP（单核苷酸多态性）。SNP标记具有密度高、分布广、自动化检测等优点，已成为MAB和GS的主流标记。