二、实验设计策略

（1）样本量计算
- 微生物组研究通常需要比传统临床研究更大的样本量
- 因为个体差异大，效应量通常较小
- 建议：初步探索性研究每组至少20-30个样本；验证性研究每组50-100个
（2）对照设置
- 阴性对照（空白对照）：检测试剂污染
- 阳性对照（mock community）：评估技术流程的准确性
- 裂解对照（spike-in）：评估DNA提取效率
（3）批次控制
- 随机化：将不同组的样本随机分配到不同批次
- 平衡设计：确保每批次包含所有组的样本
- 记录所有批次信息，以便后续统计校正
- 统计校正：使用ComBat等方法校正批次效应
（4）纵向设计
- 对于疾病研究，纵向采样（疾病前-中-后）比横断面设计更能揭示因果关系
- 建议：基线（T0）、急性期（T1）、恢复期（T2）