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concept
二、多组学整合分析策略
**(1)松散的整合(Loose Integration)** - 分别分析各组学数据 - 比较不同组学层面的结果,寻找一致性 - 例如:比较差异物种和差异代谢物,寻找相关性 **(2)统计学整合(Statistical Integration)** - 使用多变量统计方法整合多个数据矩阵 - **CCA(Canonical Correlation Analysis)**:寻找两个数据集之间的最大...
📖 定义
(1)松散的整合(Loose Integration)
- 分别分析各组学数据
- 比较不同组学层面的结果,寻找一致性
- 例如:比较差异物种和差异代谢物,寻找相关性
(2)统计学整合(Statistical Integration)
- 使用多变量统计方法整合多个数据矩阵
- CCA(Canonical Correlation Analysis):寻找两个数据集之间的最大相关
- sPLS(sparse Partial Least Squares):寻找预测关系的同时进行变量选择
- MCIA(Multiple Co-Inertia Analysis):整合多个组学数据集
- MOFA(Multi-Omics Factor Analysis):分解共享和特异的变异源
(3)网络整合(Network Integration)
- 构建跨组学的关联网络
- 例如:物种-代谢物关联网络、基因-代谢物关联网络
- 识别网络中的关键节点(hub)
(4)机器学习整合
- 将多组学特征作为输入,训练预测模型
- 使用特征选择识别最重要的预测因子