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concept
三、ChIP-Seq技术原理
**实验流程**: 1. **交联**:甲醛处理细胞,共价固定蛋白质-DNA复合物 2. **裂解**:超声波打断染色质,获得约200 bp的DNA片段 3. **免疫沉淀**:用特异性抗体捕获目标蛋白及其结合的DNA片段 4. **解交联**:去除蛋白质,纯化DNA 5. **测序**:构建测序文库,进行高通量测序 **技术特点**: - 需要生物学重复(通常2-3次)以提高可靠性 - 人类/小...
📖 定义
实验流程:
1. 交联:甲醛处理细胞,共价固定蛋白质-DNA复合物
2. 裂解:超声波打断染色质,获得约200 bp的DNA片段
3. 免疫沉淀:用特异性抗体捕获目标蛋白及其结合的DNA片段
4. 解交联:去除蛋白质,纯化DNA
5. 测序:构建测序文库,进行高通量测序
技术特点:
- 需要生物学重复(通常2-3次)以提高可靠性
- 人类/小鼠转录因子ChIP-Seq建议测序深度约2000万reads
- 对照样本(Input或IgG)用于背景校正