💡
concept
六、ChIA-PET数据分析
**主要步骤**： 1. 比对：将双末端标签比对到参考基因组 2. 分类：将唯一比对标签分为自连接（同一基因组区域）和间连接（不同基因组区域） 3. 过滤：去除PCR重复和低质量连接 4. 富集分析：将相互作用锚点视为ChIP-Seq信号峰，进行peak calling 5. 环识别：基于锚点之间的连接频率，识别显著互作对 **常用工具**：ChIA-PET Tools
📖 定义
主要步骤：
1. 比对：将双末端标签比对到参考基因组
2. 分类：将唯一比对标签分为自连接（同一基因组区域）和间连接（不同基因组区域）
3. 过滤：去除PCR重复和低质量连接
4. 富集分析：将相互作用锚点视为ChIP-Seq信号峰，进行peak calling
5. 环识别：基于锚点之间的连接频率，识别显著互作对
常用工具：ChIA-PET Tools