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案例二:水稻分子标记辅助抗病育种

水稻白叶枯病是由Xanthomonas oryzae pv. oryzae引起的严重病害。通过QTL定位,科学家发现了多个抗性基因(如Xa21、Xa23、Xa27)。 1. **标记开发**:开发与Xa21紧密连锁的PCR标记(如PTA248)。 2. **前景选择**:在BC1F1回交后代中,利用PCR标记筛选携带Xa21的个体。 3. **背景选择**:利用全基因组SNP标记,选择轮回亲本基因...

📖 定义

水稻白叶枯病是由Xanthomonas oryzae pv. oryzae引起的严重病害。通过QTL定位,科学家发现了多个抗性基因(如Xa21、Xa23、Xa27)。
1. 标记开发:开发与Xa21紧密连锁的PCR标记(如PTA248)。
2. 前景选择:在BC1F1回交后代中,利用PCR标记筛选携带Xa21的个体。
3. 背景选择:利用全基因组SNP标记,选择轮回亲本基因组恢复率最高的个体。
4. 结果:仅需2-3个回交世代即可获得基因组恢复率>95%的抗性近等基因系,而传统回交需要6-7代。

# Xa21前景选择PCR标记检测
# 引物序列:正向 5'-GCTCGATCGATAATGGAAGG-3'
#          反向 5'-TTGGTGATGGTTCGACGAGC-3'
PCR反应体系(20 μL):
- 2× PCR Mix: 10 μL
- 正向引物 (10 μM): 0.5 μL
- 反向引物 (10 μM): 0.5 μL
- DNA模板 (50 ng/μL): 1 μL
- ddH2O: 8 μL
PCR程序:
94°C 5min
[94°C 30s → 55°C 30s → 72°C 1min] × 35 cycles
72°C 7min
预期结果:携带Xa21的个体扩增出约500 bp的条带