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案例二:非小细胞肺癌的精准治疗

一名65岁女性患者诊断为晚期肺腺癌。肿瘤组织RNA-seq和DNA-seq分析显示EML4-ALK基因融合(variant 1)。生物信息学分析通过STAR-Fusion检测到EML4基因的第13号外显子与ALK基因的第20号外显子融合。基于这一结果,患者接受了ALK抑制剂克唑替尼(Crizotinib)治疗,而非传统的化疗,获得了显著的临床获益。 融合基因检测流程: 1. RNA-seq数据质控...

📖 定义

一名65岁女性患者诊断为晚期肺腺癌。肿瘤组织RNA-seq和DNA-seq分析显示EML4-ALK基因融合(variant 1)。生物信息学分析通过STAR-Fusion检测到EML4基因的第13号外显子与ALK基因的第20号外显子融合。基于这一结果,患者接受了ALK抑制剂克唑替尼(Crizotinib)治疗,而非传统的化疗,获得了显著的临床获益。
融合基因检测流程:
1. RNA-seq数据质控(FastQC)
2. STAR比对(使用chimeric alignment模式)
3. STAR-Fusion或Arriba检测融合基因
4. 可视化验证(IGV查看融合断点)
5. 临床解读(OncoKB数据库查询靶向药物)