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algorithm
FastQC原理
FastQC从多个维度评估测序数据质量： - **基本统计**：总reads数、序列长度、GC含量 - **每个碱基的质量**：箱线图展示read各位置的质量分布 - **每个序列的质量**：所有reads平均质量的分布 - **每个碱基的序列含量**：各位置A/T/G/C的比例（应接近一致） - **GC含量**：样本GC分布与理论正态分布的比较 - **接头序列**：检测已知接头序列的污染 -...
📖 定义
FastQC从多个维度评估测序数据质量：
- 基本统计：总reads数、序列长度、GC含量
- 每个碱基的质量：箱线图展示read各位置的质量分布
- 每个序列的质量：所有reads平均质量的分布
- 每个碱基的序列含量：各位置A/T/G/C的比例（应接近一致）
- GC含量：样本GC分布与理论正态分布的比较
- 接头序列：检测已知接头序列的污染
- 序列重复：评估PCR重复和过度表达的序列